يتبع قسم الجودة إدارياً في الهيكل التنظيمي لوكالة التخطيط والجودة ويعد أحد الأقسام المهمة والمساندة في الإدارة العامة للتعليم، حيث يعنى بالإشراف على عمليات تطبيق أفضل معايير الجودة، ودعم ومساندة ضمان سير أعمال وانشطة الجودة المختلفة التي تقوم بها الإدارات والوكالات بقطاع الإدارة العامة التعليم، ومن ضمن أهدافه تطبيق السياسات والإجراءات وفق منظومة إدارة الجودة، ويسعى دائما لبناء نظام فعال لضمان الجودة والاعتماد الأكاديمي لجميع منسوبي الإدارة العامة للتعليم بالجبيل.

كما يعتبر قسم الجودة الجهة المسؤولة عن الأعمال الإدارية والتنظيمية المتعلقة بأنظمة إدارة الجودة ووضع معايير لتحقيقها للوصول الى أفضل معايير الجودة والاعتماد الأكاديمي من خلال بناء المنصات الالكترونية لأتمته وتوثيق عمليات الاعتماد الأكاديمي البرامجي والمؤسسي ومواصفات الأيزو ودعم الكليات والمعاهد للمحافظة على الاعتمادات الاكاديمية المحلية والدولية لتحقيق العديد من الأهداف التي تسهم في تحسين جودة الأداء في مخرجات كافة عمليات الجودة التعليمية والتدريبية.

كما يسعى القسم إلى نشر ثقافة الجودة والاعتماد ومفاهيم نظم إدارة الجودة على مستوى إدارات ووكالات الإدارة العامة للتعليم من خلال إقامة المحاضرات والندوات والدورات التدريبية وورش العمل بالتعاون مع الأقسام والوكالات المعنية بالتطوير والجودة بقطاع التعليم.

قام قسم الجودة ببناء منصة إدارة منظومة الجودة QMS2 لتعتبر النافذة الالكترونية لجميع منسوبي الإدارة العامة للتعليم ( التعليم العالي ) ، والتي يتم عن طريقها نشر الرؤية والرسالة والأهداف الاستراتيجية للتعليم العالي في الإدارة العامة للتعليم ,وكذلك السياسات والإجراءات والنماذج الموحدة, إضافة إلى الوصوفات الوظيفية ، ويتم مراجعة المنصة بشكل دوري مع إشراك أصحاب المصلحة من منسوبي الإدارة العامة للتعليم بالجبيل لإبداء أي ملاحظات حيالها ، حيث يتم جمعها ودراستها بشكل دقيق لضمان فعاليتها وكفاءتها.